新生儿睡觉抽搐可能由多种原因引起。一般来说，新生儿大脑发育尚不完善，约有20%的新生儿会出现睡眠中肢体抽动的情况。
神经系统发育不完善导致
大脑皮层兴奋性高： 新生儿的大脑皮层发育还不成熟，神经细胞的稳定性较差，容易出现兴奋性过高的情况，从而导致睡觉抽搐。这种情况通常会随着宝宝月龄的增长逐渐改善，一般在出生后3 - 4个月左右会明显减少。中枢神经递质调节失衡： 新生儿体内的一些中枢神经递质，如γ - 氨基丁酸等的调节还不稳定，也可能引发睡觉抽搐现象。这是新生儿自身生理发育过程中的正常阶段表现。
外界刺激因素影响
声音刺激： 突然的声响可能会引起新生儿睡觉抽搐。比如关门声、较大的说话声等，哪怕是相对较小的声音，对于新生儿敏感的神经系统来说，都可能成为刺激源，导致肢体出现短暂的抽搐反应。光线刺激： 强烈的光线照射也可能让新生儿睡觉不踏实并出现抽搐。新生儿的视觉系统还在发育中，过强的光线会干扰其神经系统的正常功能，进而引发肢体的抽动表现。
营养缺乏相关原因
钙缺乏： 新生儿如果体内钙元素不足，会影响神经肌肉的兴奋性，导致睡觉抽搐。正常足月新生儿出生后体内储存的钙在出生后一段时间可能会相对不足，如果没有及时补充，就容易出现这种情况。一般母乳喂养的新生儿，妈妈要注意自身钙的摄入，以保证乳汁中钙的含量充足；配方奶喂养的新生儿，要选择钙含量合适的配方奶。维生素D缺乏： 维生素D能促进钙的吸收，如果新生儿缺乏维生素D，也会间接影响钙的利用，导致神经肌肉兴奋性增高，出现睡觉抽搐。新生儿出生后不久就应该开始补充维生素D，一般建议每天补充400国际单位，以预防维生素D缺乏性佝偻病等问题，从而减少睡觉抽搐因营养缺乏导致的情况。