经期同房后小腹出现轻微疼痛，可能是由急性宫颈炎、盆腔炎、子宫内膜异位症等原因导致。不同病因有不同治疗方法。
一、急性宫颈炎：
1.若女性在月经期间同房时卫生清洁不到位，就可能引发生殖系统炎症感染，进而出现急性宫颈炎症，使宫颈局部充血、水肿，从而导致小腹轻微疼痛，通常还伴有白带增多且呈黄脓性的表现。
2.建议对患者阴道分泌物进行细菌培养或其他病原菌培养，以明确病原体，从而进行针对性治疗。比如，若是淋菌引起的，常使用注射用头孢曲松钠、头孢克肟胶囊等药物；若是由支原体、衣原体等感染导致的，则常用阿奇霉素片、多西环素片等药物。
二、盆腔炎：
1.一般情况下，女性月经期间子宫内膜会脱落，宫口处于开放状态，此时身体的抵抗力和免疫力相对较弱。如果这时发生性生活，可能会导致细菌侵入体内，增加子宫感染的几率，可能引发盆腔炎。病原体的侵入会使盆腔组织的黏膜肿胀充血，导致炎性组织渗出，刺激盆腔腹膜进而引起小腹轻微疼痛。
2.可以在医生指导下口服头孢类的消炎药，如头孢克肟分散片、头孢呋辛酯片等药物。也可以使用青霉素类的消炎药，像罗红霉素胶囊、阿奇霉素片等药物进行治疗。日常要多注意休息，注意腹部保暖。
三、子宫内膜异位症：
1.当女性同房出现性兴奋时，通常会出现子宫收缩，此时就可能容易发生经血逆流到盆腔的情况，进而引起子宫内膜的种植，从而导致子宫内膜异位症。子宫内膜组织生长在子宫腔以外的位置，通常会使女性出现小腹轻微疼痛。
2.药物治疗主要适用于有慢性盆腔痛、经期痛经症状明显、无卵巢囊肿形成且有生育要求的患者，比如可以使用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等。通常还需要口服屈螺酮炔雌醇片、雌二醇片等药物来抑制卵巢功能，阻止子宫内膜异位症的发展；病情较重的患者一般可以进行保留生育功能或卵巢功能的手术，并结合药物治疗，无生育要求的严重患者可进行子宫、双附件切除术。
如果经期同房后小腹轻微疼痛，建议尽早前往医院就诊，明确具体原因，按照医嘱积极治疗。以上药物均需在医生指导下使用。