扁平疣是由HPV（人乳头瘤病毒）感染导致的，若脚上长扁平疣，可通过外用药物、口服药物、物理治疗或手术治疗等方式来处理。一、外用药物：包含角质剥脱剂、细胞毒药物、局部免疫调节药等。常见的药物有维A酸软膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏等。另外，干扰素凝胶也可使用，其属于广谱抗病毒药物，能够抑制病毒复制以及增强细胞免疫功能，进而取得较好的治疗成效。使用这些药物必须严格遵循医嘱，切不可自行乱用。二、口服药物：可遵医嘱应用免疫调节剂来改善病情，例如西咪替丁片、盐酸左旋咪唑片等药物。三、物理治疗：通常可选择激光、冷冻、电灼、刮除等形式，能使皮损组织逐步坏死、脱落，从而将疣体去除。四、手术治疗：一般是利用手术方式将自体疣植入皮下脂肪层，这样可以刺激机体释放细胞因子，从而产生抗病毒抗体，能够降低复发的概率。
总之，针对脚上的扁平疣，可根据具体情况选择合适的治疗方法，同时要注意在医生指导下进行规范治疗。