40天孕囊大小通常约为1.5cm左右，不过具体情况会受到受孕时间、月经周期以及受精卵发育不良等因素影响。
一、受孕时间：
孕囊大小和受孕时间密切相关。如果排卵较早，会较快形成受精卵，受精卵越早着床，那么孕囊发育往往就越好。而受精卵着床晚的话，孕囊发育就会相对较慢。
二、月经周期：
女性正常的月经周期一般是在28至35天之间。正常怀孕40天时孕囊大小在1.5cm，但月经周期过长或者过短都会致使孕囊偏大或偏小，不过正常的误差大概在一周左右。
三、受精卵发育不良：
倘若受精卵发育不良，其细胞分裂的速度会变慢，这也会让孕囊大小和正常大小出现较大差异。
在怀孕前期需要多加注意休息，多食用蔬菜和水果，补充营养和叶酸。要是身体有任何不适，要及时前往医院并在医生的指导下进行处理。
总之，40天孕囊大小会因多种因素而有所不同，要综合各方面情况来判断其是否正常发育，怀孕早期要做好各方面的护理。