根据你的描述，可能是以下原因导致：
1.耳垂皮肤感染：当耳部皮肤受到细菌或病毒感染时，可能会出现炎症反应，导致耳垂内出现疙瘩，并伴有疼痛。常见的感染原因包括耳部湿疹、毛囊炎等。
2.耳垂皮脂腺囊肿：这是一种常见的良性肿瘤，通常由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂潴留堆积而形成。囊肿生长缓慢，患者一般无自觉症状。如果继发感染时，可表现为局部红肿、疼痛。
3.耳垂软骨膜炎：如果患有耳廓损伤、手术、冻伤、烧伤等情况，可能会并发软骨膜炎，导致耳垂内出现疙瘩，并伴有疼痛。
4.其他：如淋巴结炎、脂肪瘤等疾病，也可能导致类似症状。
由于引起耳垂疙瘩并伴有疼痛的原因较多，且可能会对健康造成一定影响，因此建议你及时就医，进行相关检查（如血常规、B超等），以明确诊断，并采取相应的治疗措施。在就医前，应避免自行挤压、搔抓疙瘩，以免加重病情。同时，要保持耳部清洁，避免耳部受到刺激。