植物神经功能紊乱的用药需根据具体症状来选择。一般来说，调节植物神经功能的药物有谷维素，它可以调整自主神经功能，通常成人一次10 - 30毫克，一日3次。
调节神经递质类药物
盐酸帕罗西汀：属于选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂，能改善植物神经功能紊乱引起的焦虑、抑郁等情绪症状。但孕妇、哺乳期女性要慎用，且服用后可能会有恶心、口干等不良反应。维生素B族：像维生素B1、维生素B6、维生素B12等，它们参与神经细胞的代谢，对维持神经功能有重要作用。一般维生素B1一次10毫克，一日3次；维生素B6一次10 - 20毫克，一日3次；维生素B12可以肌肉注射等，具体使用需遵医嘱。
对症治疗药物
改善睡眠药物：如果植物神经功能紊乱导致失眠，可使用艾司唑仑等药物，但艾司唑仑有成瘾性，不能长期大量服用，老年人使用要特别注意剂量，一般成人一次1 - 2毫克，睡前服用。调节胃肠功能药物：当植物神经功能紊乱影响胃肠，出现胃肠不适时，多潘立酮可以促进胃肠蠕动，一次10毫克，一日3次，饭前服用，但孕妇慎用。
中医中药类
逍遥丸：具有疏肝健脾、养血调经的作用，对于植物神经功能紊乱引起的情绪抑郁、胁痛、月经不调等有一定调理作用。一般一次6 - 9克，一日1 - 2次。天王补心丹：能滋阴养血、补心安神，适用于植物神经功能紊乱出现心悸健忘、失眠多梦、大便干燥等症状的人群。孕妇慎用，服用时忌辛辣油腻。