尿道下裂主要通过手术治疗，手术时机一般建议在患儿12-18个月大时进行，这样能减少对患儿心理的影响。
手术治疗方式一：一期尿道成形术
岛状皮瓣尿道成形术： 利用自身皮肤组织形成新的尿道，适用于阴茎头型、冠状沟型尿道下裂等情况。该手术相对精细，能较好地恢复尿道的正常结构和功能。包皮内板尿道成形术： 利用包皮内板的皮肤来构建尿道，这种方法利用了自身组织，减少了异体组织带来的排异风险，对于合适的患儿是不错的选择。
手术治疗方式二：分期尿道成形术
第一期手术： 对于复杂的尿道下裂，可能先进行膀胱粘膜尿道成形术，构建尿道的基础部分。一般会在患儿稍大一些后进行，先解决尿道的基本通道问题。第二期手术： 在第一期手术恢复后，再进行进一步的修整手术，完善尿道的外观和功能，使尿道下裂的情况得到更理想的改善。
术后护理要点
伤口护理： 术后要保持手术部位清洁干燥，避免尿液污染伤口，防止感染。一般需要定期对伤口进行消毒等处理，按照医生要求更换敷料。排尿观察： 密切观察患儿术后排尿情况，确保尿道通畅，若发现排尿异常，如排尿困难、尿线变细等，要及时告知医生进行处理。同时，要鼓励患儿适量饮水，保证尿量，起到自然冲洗尿道的作用。