治疗新生儿尿道下裂的方法主要包括手术治疗和分期手术治疗，以下是具体的治疗方法：
1.手术治疗：
一期手术：矫正阴茎下弯，尿道成形。手术目的是使阴茎伸直，并恢复其排尿和性交功能。
二期手术：在一期手术3-6个月后进行。主要是重建尿道，使尿道开口于阴茎头的正常位置。
2.分期手术治疗：
第一期：矫治阴茎下弯，做一个新的尿道。
第二期：在第一期手术后3-6个月，待局部瘢痕组织软化后，再做尿道成形术。
需要注意的是，每个新生儿的情况都不同，医生会根据具体情况选择最适合的治疗方法。在治疗过程中，家长需要密切配合医生的治疗，注意术后护理，帮助新生儿尽快恢复。