眼睛结膜炎是由多种因素引起的，常见的有感染因素，比如细菌感染可能在10% - 30%的结膜炎病例中起作用，像金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等细菌感染眼部就易引发结膜炎；病毒感染也是重要原因，腺病毒引起的流行性角结膜炎较为常见，能通过接触等方式传播。
感染性因素导致
细菌感染： 当眼部接触到带有细菌的物品后，细菌可能附着在眼表并繁殖，引发炎症反应。例如在卫生条件较差的环境中，用手揉眼后就容易让细菌侵入眼部，导致结膜炎发生。病毒感染： 像肠道病毒等感染眼部时，会引起结膜的炎症。病毒可通过飞沫、接触被污染的物品等途径传播到眼睛，从而引发结膜炎，而且病毒性结膜炎往往具有一定的传染性，容易在人群中传播。
非感染性因素导致
过敏因素： 过敏体质的人接触到过敏原时，比如花粉、尘螨、动物毛发等，眼部的结膜会发生过敏反应，出现红肿、瘙痒等结膜炎症状。例如春季时花粉较多，过敏体质者接触花粉后就可能引发过敏性结膜炎。物理刺激： 强光、烟雾、化学物质等物理或化学刺激也会引起结膜炎。比如长时间在强光下暴露，或者工作中接触到刺激性化学物质，都可能刺激眼部结膜，导致炎症出现。例如在电焊工作中，如果没有做好防护，强光和紫外线等刺激就容易引发电光性眼炎，这也属于结膜炎的一种类型。其他因素： 一些全身性疾病也可能累及眼部结膜引发炎症，比如类风湿关节炎等自身免疫性疾病。另外，长期佩戴隐形眼镜，如果不注意清洁和护理，也容易导致眼部感染，引发结膜炎，一般来说，不注意隐形眼镜护理的人群中，约有一定比例会出现结膜炎问题。