双侧乳腺小叶增生的主要治疗方式包括药物治疗、物理治疗以及手术治疗。双侧乳腺小叶增生是常见的乳腺良性病变，由卵巢功能紊乱导致雌激素水平过高且与黄体素比例失调引起，主要病理特征为乳腺腺泡及导管末段的上皮细胞过度增生。
一、药物治疗：
1.可采用抑制雌激素类药物，如乙烯雌酚、黄体酮、睾酮、溴隐亭、达那唑、他莫昔芬等，能够改善症状。其中他莫昔芬对症状较重者效果较好，但因对子宫内膜及卵巢有影响，所以不宜长期服用。
2.维生素类药物，如维生素E、维生素B、维生素A等具有调节性激素的作用，常作为辅助用药。
二、物理治疗：
可运用按摩、冷敷、红外线照射等物理辅助疗法，有助于改善乳房胀痛症状。
三、手术治疗：
局限性乳腺囊性增生病若肿块变软、缩小或消退，可进行观察并继续治疗。若肿块无明显消退或存在可疑恶性病变，则应进行局部切除并作快速病理检查。若患者活检证实有不典型上皮增生，同时有对侧乳腺癌或有乳腺癌家族史等高危因素，以及年龄较大且肿块周围乳腺组织增生也较明显时，可进行单纯乳房切除术。
患者还应保持营养均衡，做到三餐规律，饮食以低脂肪、低热量食物为主，也可多食用高纤维的新鲜蔬菜、水果。
总之，双侧乳腺小叶增生的治疗方法多样，需根据具体情况选择合适的治疗方式，同时患者要注重日常饮食和生活习惯，以促进康复。