肛门旁边肉疙瘩是否会自愈取决于其成因。若为肛周毛囊炎通常可自愈，局部湿疹也能自愈，但痔疮一般自愈可能性极小，一旦形成很难消失。
肛门肉疙瘩的原因及解决办法如下：
一、肛周毛囊炎：
1.成因：肛周皮肤较为潮湿，穿紧身内裤或久坐易引发肛周毛囊炎，会导致局部红肿疼痛。
2.解决办法：
(1)自愈：多数可自愈，肛周毛囊属体表最表浅腺体，若发生炎症感染出现疼痛、红肿，不及时治疗毛囊会逐渐变大甚至破溃，破溃后基本可自愈。
(2)服药：部分毛囊炎会形成疖肿或肛周脓肿，可在医生建议下积极涂抹红霉素软膏或口服抗生素，以防治疗不及时病情加重。
二、肛周湿疹：
1.成因：专指发生于肛门周围皮肤的变态反应性皮肤病，具有多形性皮损、明显渗出倾向、反复发作、病程不定、经久不愈及易复发等特点。
2.解决办法：
(1)避免刺激：避免各种可能致病的外界刺激，如过度搔抓、洗拭、潮湿、积汗、皮毛制品、刺激性食物等。
(2)药物治疗：可在医生指导下服用醋酸铝、氧化锌软膏、维生素B、维生素C等药物缓解病情。
三、痔疮：
1.成因：是发生于肛门齿线上下的病变，为最常见肛肠疾病，包括内痔、外痔、混合痔三种类型，患者可表现为出血、痔块脱垂、肛门瘙痒、肛门潮湿等症状。
2.解决办法：
(1)调整饮食习惯：若出血量较少，可暂不处理，但要注意调整饮食习惯，多吃含膳食纤维高的食物，如芹菜、白菜、苹果、火龙果等，避免食用辛辣刺激性食物，同时多喝水以减少大便干燥，避免粪便再次刺激痔疮，降低出血感染风险。
(2)局部用药：若出血量较大，可在医生建议下外涂活血化瘀药膏促进伤口愈合，如云南白药等，也可从肛门口塞入痔疮栓（如复方角菜酸酯栓等）或涂抹痔疮膏（如麝香痔疮膏等）以止血。
(3)手术治疗：若出血量很大且保守治疗无效，应及时到正规医院肛肠外科或普通外科手术治疗，以免因出血过多引起失血性休克等严重并发症。
总之，对于肛门旁肉疙瘩要明确原因，根据不同情况选择合适的处理方法。