吃了紧急避孕药第二天小腹疼，可能是以下原因引起：
1.药物副作用：紧急避孕药含有大量的孕激素，服用后可能会引起恶心、呕吐、头痛、乳房胀痛等症状，也可能导致小腹疼。这种情况通常不需要特殊处理，症状会在1-3天内自行缓解。
2.撤退性出血：服用紧急避孕药后，可能会出现撤退性出血，这是药物的副作用之一。撤退性出血通常发生在服药后的1-2周内，出血量一般较少，持续时间较短。如果小腹疼伴随着出血，可能是撤退性出血引起的。
3.其他：如果本身有盆腔炎、宫颈炎等妇科炎症，服用紧急避孕药后可能会加重炎症，导致小腹疼。此外，服用紧急避孕药可能会影响月经周期，导致月经提前或推迟，如果小腹疼伴随着月经异常，也可能是药物的副作用引起的。
需要注意的是，紧急避孕药不能作为常规的避孕方法，因为它的副作用比较大，且避孕成功率并不是100%。如果小腹疼持续不缓解或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐、阴道分泌物异常等，应及时就医，进行相关检查，以排除其他疾病的可能。
此外，服用紧急避孕药后，可能会对月经周期产生影响，导致月经提前或推迟。如果月经推迟超过1周，应及时进行验孕，以排除怀孕的可能。同时，紧急避孕药也可能会影响卵巢功能，导致内分泌失调。因此，建议在医生的指导下服用紧急避孕药，并尽量避免频繁使用。如果没有怀孕的计划，应采取其他有效的避孕措施，如使用避孕套、口服短效避孕药等。