肌肉萎缩的原因有多种。比如神经源性因素，像运动神经元病，它会导致神经对肌肉的支配出现问题，进而引起肌肉逐渐萎缩，这种疾病在临床上有一定的发病概率。
神经源性因素
脊髓病变： 脊髓的一些病变，例如脊髓空洞症，会影响神经传导，使得相应支配区域的肌肉得不到正常的神经信号，从而慢慢发生萎缩。脑部病变： 脑部的某些疾病，像脑梗死影响到支配肌肉运动的神经传导通路时，也可能引发肌肉萎缩，例如脑部血管堵塞后，相应控制的肢体肌肉可能会出现萎缩情况。
肌源性因素
遗传因素导致的肌病： 有些肌肉疾病是遗传因素引起的，比如杜氏肌营养不良症，这是一种X连锁隐性遗传疾病，多见于男性儿童，会逐渐出现进行性的肌肉萎缩。炎症性肌病： 像多发性肌炎，是一种自身免疫性疾病，肌肉会受到炎症攻击，导致肌肉萎缩，患者可能会有肌肉无力、疼痛等表现。
废用性因素
长期不活动： 当人体某个部位因为骨折等原因长时间固定，不能正常活动时，该部位的肌肉就会因为缺乏运动刺激而发生废用性萎缩。比如骨折后打石膏固定的肢体，如果长时间不活动，肌肉就会慢慢变细萎缩。制动状态： 一些疾病导致长期卧床的患者，全身肌肉都会有废用性萎缩的风险，长期卧床超过1个月，肌肉萎缩的程度可能会比较明显。