小脑扁桃体下疝的处理需要根据具体情况来定。如果没有症状，可能定期观察即可；若出现相关症状，可能需要手术治疗等。
观察随访情况
无症状的轻度下疝： 对于一些影像学检查发现小脑扁桃体下疝，但没有任何神经系统症状的患者，通常建议定期进行神经系统检查和影像学复查，比如每6 - 12个月进行一次磁共振成像（MRI）检查，观察下疝情况是否有变化。儿童患者的观察： 儿童小脑扁桃体下疝需密切关注，因为儿童处于生长发育阶段，要留意是否出现头痛、颈部疼痛、肢体无力等症状，一旦有异常表现需及时进一步评估。
手术治疗情况
出现神经症状的情况： 当小脑扁桃体下疝导致患者出现明显的神经系统症状，如持续性头痛且进行性加重、肢体感觉异常、运动障碍、吞咽困难、呼吸困难等时，往往需要考虑手术治疗。手术的主要目的是解除枕骨大孔及颈椎管对小脑、脑干、脊髓、第四脑室及后组颅神经的压迫，重建脑脊液循环通路。常见的手术方式有后颅窝减压术等。手术时机选择： 一般来说，一旦明确因为小脑扁桃体下疝导致神经功能进行性受损，应尽早考虑手术，避免神经功能损害进一步加重，但具体手术时机还需由神经外科医生根据患者的具体病情综合判断。
非手术对症治疗情况
头痛的对症处理： 如果患者有头痛症状，可在医生指导下使用非甾体类抗炎药缓解疼痛，如对乙酰氨基酚等，但这类药物只能暂时缓解症状，不能从根本上解决小脑扁桃体下疝的问题。呼吸功能相关问题处理： 对于出现呼吸功能受影响的患者，可能需要进行呼吸监测等，若有必要可进行呼吸支持治疗，比如在严重情况下可能需要短期使用呼吸机辅助呼吸等，但这只是对症的过渡措施，根本还是要针对小脑扁桃体下疝的病因处理。