结节和囊肿在性质、影像学表现及处理方式上有区别。结节是一种实质性的病变，可分为良性和恶性，比如肺部结节，直径小于5毫米的微小结节，良性的可能性相对大些；而囊肿大多是良性的，是含有液体或其他物质的囊状结构。
从性质来看
结节： 结节的本质是细胞异常增生形成的团块，其成分多样，可能是组织细胞的聚集等。比如甲状腺结节，有的是甲状腺细胞异常增殖形成的，有良性也有恶性的可能。恶性结节如肺癌的结节，细胞生长失去正常调控，会不断增殖并可能转移。囊肿： 囊肿一般是囊壁包裹着内容物，内容物多为液体、气体或其他成分。像肝囊肿，是肝脏内出现的含有液体的囊腔，囊壁是一层上皮细胞等组成的包膜。
影像学表现方面
结节： 在CT或超声等影像学检查下，结节表现为密度或回声与周围组织不同的团块状结构。比如乳腺结节，超声下可能显示为低回声的团块，边界情况等需要进一步判断良恶性。囊肿： 囊肿在影像学上通常表现为边界清晰的圆形或椭圆形病灶，内部为液性暗区或低密度影。例如卵巢囊肿，超声检查时能看到卵巢部位有边界清楚的无回声区。
处理方式上
结节： 如果是肺部结节，小于1厘米的纯磨玻璃结节，可能需要3 - 6个月复查CT观察变化；如果是怀疑恶性的结节，可能需要进一步做穿刺活检等明确性质，再决定手术等治疗方案。对于甲状腺结节，若考虑恶性可能，需手术切除。囊肿： 较小的肝囊肿、肾囊肿等，如果没有症状，一般定期复查即可。但如果囊肿较大，压迫周围组织出现相应症状，比如肝囊肿直径大于5厘米且有压迫症状，可能需要穿刺抽液或手术治疗。像卵巢囊肿，如果囊肿直径大于5厘米持续存在，也可能需要手术处理。