小阴唇两侧起了小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.外阴炎：如果平时不注意个人卫生，或使用不合格的卫生巾、卫生纸，可能导致外阴炎，出现小阴唇两侧起小疙瘩、瘙痒、疼痛等症状。
2.阴道炎：阴道炎也可能导致小阴唇两侧起小疙瘩，同时还可能伴有白带异常、异味等症状。引起阴道炎的原因有很多，如细菌、真菌、滴虫等感染，或内分泌失调、免疫力下降等。
3.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的一种性传播疾病，主要通过性接触传播。尖锐湿疣通常表现为小阴唇两侧的乳头状、菜花状或鸡冠状的赘生物，表面湿润，触碰后容易出血。
4.假性湿疣：假性湿疣是一种良性乳头瘤病，可能与念珠菌感染、滴虫感染、慢性炎症刺激等有关。主要表现为小阴唇两侧对称分布的小米粒大小的丘疹，颜色与周围皮肤相近，无明显自觉症状。
5.其他：药物过敏、生殖器疱疹、梅毒等也可能导致小阴唇两侧起小疙瘩。
如果发现小阴唇两侧起了小疙瘩，建议及时就医，进行相关检查，如白带常规、HPV检测等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免搔抓和摩擦，避免食用辛辣、刺激性食物。