每天三点多就醒可能是由以下疾病导致：
一、植物神经功能紊乱。如果存在内分泌紊乱、心理曾受过创伤、有不良生活习惯等情况，就可能引发植物神经功能紊乱，进而出现每天三点多就醒的现象。治疗上可遵医嘱服用维生素B1、谷维素等药物。平时要做到规律作息，调整好心态，减少摄入含有兴奋成分的食物。具体如下：
1.维生素B1：是维持神经系统正常功能的重要营养物质。
2.谷维素：可调节植物神经功能。
二、抑郁症。性格敏感、害羞、内向，或者有被虐待、被冷淡等阴影经历的人，可能会患上抑郁症从而引起早醒现象。治疗可遵医嘱服用米氮平、西酞普兰等药物，也可以通过行为认知疗法、催眠疗法、团体疗法等心理方式来改善。具体如下：
1.米氮平：用于治疗抑郁症。
2.西酞普兰：对抑郁症有较好疗效。
三、睡眠呼吸暂停综合征。对于有巨舌症、肺心病、慢阻肺、鼻中隔偏曲、肥胖等现象的患者，容易出现睡眠呼吸暂停综合征，从而导致睡眠质量不好。改善方法可以通过吸氧、减肥等，部分患者也可以通过手术的方式切除扁桃体、鼻息肉、纠正鼻中隔以缓解症状。具体如下：
(1)吸氧：提高血氧饱和度。
(2)减肥：减轻体重对改善病情有帮助。
总结：每天三点多就醒可能与多种疾病相关，如植物神经功能紊乱、抑郁症、睡眠呼吸暂停综合征等，应根据具体病因采取相应的治疗和改善措施。