胎记造成的主要原因目前尚未完全明确，但一般认为与以下因素有关。首先，遗传因素是其中一个方面，有研究表明部分胎记具有一定的遗传倾向，如果家族中有亲属患有胎记相关情况，那么个体出现胎记的概率可能会相对较高。
胚胎发育过程异常
血管发育异常： 在胚胎发育的早期，血管组织的分化出现异常，就可能导致血管畸形，从而形成血管型胎记，比如鲜红斑痣就是由于胚胎时期血管发育缺陷所引起的。色素细胞聚集： 当胚胎中的色素细胞在迁移过程中出现异常，导致色素细胞在皮肤局部聚集，就会形成色素型胎记，像太田痣就是因为胚胎发育时，黑素细胞从神经嵴向表皮移行期间停留在真皮深部而形成的。
孕期母体情况影响
孕期营养不均衡： 如果孕妇在孕期摄入的营养不均衡，缺乏某些特定的维生素或矿物质等，可能会影响胚胎的正常发育，增加胎儿出现胎记的风险。例如缺乏叶酸时，胎儿发生血管畸形等情况的可能性可能会有所改变。孕期受到外界刺激： 孕妇在孕期如果受到某些外界因素的刺激，比如腹部受到不当的碰撞等，虽然这种情况导致胎记的机制尚不十分明确，但有研究推测可能会对胚胎的皮肤发育产生影响，进而引发胎记。
其他未知因素
环境因素： 虽然具体机制不清，但孕期所处的环境也可能对胎记的形成有一定作用。比如孕妇长期处于污染较为严重的环境中，接触了一些有害的化学物质等，可能会干扰胚胎的正常发育过程，增加胎记发生的几率。基因变异： 除了遗传因素外，胚胎发育过程中基因的偶然变异也可能导致胎记的出现，不过这种基因变异的具体触发因素目前还在进一步研究中。