灰指甲医学上称为甲真菌病，治疗方法有多种，一般可以通过外用药物、口服药物以及手术等方式来处理。比如外用抗真菌药物，像阿莫罗芬搽剂，每周使用1 - 2次，坚持使用几个月可能有效果，但起效相对较慢。
外用药物治疗
局部涂抹药物： 常用的有30%冰醋酸溶液，需要每天涂抹病甲，不过要注意它对正常皮肤有一定刺激性，使用时要小心别弄到周围好的皮肤上。阿莫罗芬甲涂剂： 它是一种局部外用的抗真菌药，通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥作用，每周使用1 - 2次，连续使用几个月，对较轻的灰指甲有一定疗效。
口服药物治疗
伊曲康唑： 可以采用冲击疗法，即每天服用2次，每次200mg，连服7天，然后停药3周，为一个疗程。一般需要服用2 - 3个疗程，不过服用前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响。特比萘芬： 一般是每天口服250mg，疗程相对较短，手指甲癣通常需要服用6 - 8周，脚趾甲癣需要服用12 - 16周，同样服用前也要关注肝功能情况。
手术治疗情况
拔甲术： 过去会采用拔甲的方法来治疗灰指甲，但现在已经不太常用了。因为拔甲创伤比较大，而且术后恢复时间较长，还容易复发，现在更多是采用药物治疗为主。不过对于单发的、病情比较严重的灰指甲，在药物治疗效果不佳时，可能会考虑这种方法，但术后需要精心护理，防止感染等并发症。
日常注意事项
个人卫生： 要保持足部和手部的清洁干燥，勤换袜子和鞋子，避免与他人共用拖鞋、脚盆、指甲刀等物品，防止交叉感染。避免刺激： 尽量不要让病甲受到外伤、挤压等，因为指甲受伤后可能会加重灰指甲的病情，而且不利于恢复。同时，也要避免长时间浸泡在水中，比如长时间泡脚等，因为潮湿的环境有利于真菌的生长繁殖。