萎缩性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，一般会用到抑制胃酸分泌药、保护胃黏膜药以及调节胃动力药等。比如常用的抑制胃酸分泌药有质子泵抑制剂，像奥美拉唑，它能有效减少胃酸分泌，缓解因胃酸过多导致的胃部不适，这类药物通常需要连续服用一段时间来控制病情。
抑制胃酸分泌药
质子泵抑制剂：这类药物能强效抑制胃酸分泌，常见的有奥美拉唑、兰索拉唑等。它们通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后一步，从而减轻胃酸对胃黏膜的刺激。一般来说，这类药物需要按照医生的嘱咐规范服用。H₂受体拮抗剂：如雷尼替丁、法莫替丁等，也是通过抑制胃酸分泌来发挥作用，不过相对质子泵抑制剂作用稍弱一些，可用于轻度萎缩性胃炎患者的症状控制。
保护胃黏膜药
铋剂：像枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，阻挡胃酸、胃蛋白酶等对胃黏膜的侵蚀，还能促进胃黏膜的修复。通常需要连续服用一段时间，一般疗程可能在几周左右。铝碳酸镁：能中和胃酸，同时保护胃黏膜，它可以快速缓解胃部的烧心、反酸等不适症状，而且服用比较方便，按需服用即可，但也需要遵医嘱使用。
调节胃动力药
多潘立酮：可以促进胃排空，改善消化不良的症状，比如腹胀、早饱等情况。一般建议在饭前半小时左右服用，能较好地发挥促进胃动力的作用。莫沙必利：也是常用的调节胃动力药物，它能促进胃肠道的蠕动，帮助食物更好地消化和排空，对于萎缩性胃炎伴有胃肠动力不足的患者较为适用。
针对幽门螺杆菌感染的药物
如果萎缩性胃炎伴有幽门螺杆菌感染，通常需要进行四联疗法，即一种质子泵抑制剂+两种抗生素+一种铋剂。抗生素常用的有阿莫西林、克拉霉素等，不过具体的抗生素选择需要根据患者的药物过敏史等情况来定，一般疗程为10 - 14天。