萎缩性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，常用的有抑酸剂、胃黏膜保护剂等。一般来说，质子泵抑制剂是常用的抑酸药物，比如奥美拉唑，它能抑制胃酸分泌，缓解胃酸过多引起的不适，临床应用较为广泛。
抑酸药物选择
质子泵抑制剂： 像奥美拉唑、兰索拉唑等都属于这类药物。它们通过抑制胃壁细胞上的质子泵，减少胃酸分泌，能有效缓解萎缩性胃炎患者因胃酸刺激胃黏膜导致的胃痛、反酸等症状。一般这类药物口服后就能发挥作用。H₂受体拮抗剂： 例如雷尼替丁、法莫替丁等。它们能竞争性阻断组胺H₂受体，减少胃酸分泌，作用相对质子泵抑制剂稍弱，但也可用于萎缩性胃炎的治疗，尤其适用于不能耐受质子泵抑制剂的患者。
胃黏膜保护剂应用
铋剂： 常见的有枸橼酸铋钾。它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，阻挡胃酸、胃蛋白酶等对胃黏膜的侵袭，还能杀灭幽门螺杆菌，对萎缩性胃炎的修复有一定帮助。通常需要按疗程服用。铝碳酸镁： 能中和胃酸，同时吸附胆汁等物质，保护胃黏膜。它可以快速缓解胃部不适，比如胃痛、烧心等症状，而且安全性较高，适合多种萎缩性胃炎患者使用。
针对幽门螺杆菌的药物
如果萎缩性胃炎伴有幽门螺杆菌感染，就需要进行根除幽门螺杆菌治疗。一般采用四联疗法，即质子泵抑制剂+铋剂+两种抗生素。抗生素常用阿莫西林、克拉霉素等。比如质子泵抑制剂选奥美拉唑，铋剂选枸橼酸铋钾，抗生素选阿莫西林和克拉霉素，这四种药物联合使用，疗程通常为10 - 14天，能有效根除幽门螺杆菌，从而改善萎缩性胃炎的病情。
中药辅助治疗
一些中药也可辅助治疗萎缩性胃炎，比如养胃舒胶囊，它具有滋阴养胃的作用，对于萎缩性胃炎属气阴两虚证的患者有一定的调理效果。但中药的使用需要在中医师的辨证论治下进行，根据患者的具体病情来选择合适的中药方剂或中成药。不过中药治疗一般作为辅助手段，不能替代西药的规范治疗。