治疗勃起功能障碍的药物主要有以下几类。目前常用的有磷酸二酯酶5抑制剂，这类药物中的西地那非，一般在性活动前约1小时服用，部分患者服用后15-30分钟就可能起效。
磷酸二酯酶5抑制剂类
西地那非： 通过抑制磷酸二酯酶5的活性，增加阴茎海绵体内环磷酸鸟苷水平，促使平滑肌松弛，血液流入，从而发挥勃起功能改善作用。一般推荐在性活动前按需服用，但需注意，正在服用硝酸酯类药物的患者禁用，因为可能会导致严重低血压。伐地那非： 同样属于磷酸二酯酶5抑制剂，起效时间相对较快，通常在性活动前25-60分钟服用，药效持续时间约为5-6小时。它也有一些禁忌，比如与强效CYP3A4抑制剂合用时需谨慎调整剂量，同时也禁止与硝酸酯类药物合用。他达拉非： 作用时间较长，有每日一次和按需服用两种服用方式。每日一次服用时，约连续服用几天后达到稳定的血药浓度；按需服用时，在性活动前30分钟左右服用即可，药效可持续36小时左右。他达拉非的禁忌证与其他磷酸二酯酶5抑制剂类似，服用硝酸酯类药物者禁用。
雄激素类药物
对于因雄激素缺乏导致勃起功能障碍的患者，可考虑使用雄激素类药物。比如十一酸睾酮胶丸等。但使用这类药物前需要进行相关检查，如测定血清睾酮水平等，而且患有前列腺癌或可疑前列腺癌的患者禁用，同时应定期监测前列腺特异性抗原等指标。
其他药物
还有一些其他药物也可能用于勃起功能障碍的治疗，比如育亨宾等。育亨宾是一种α2肾上腺素能受体拮抗剂，可能通过调节神经递质等发挥一定作用，但它的疗效个体差异较大，而且可能会引起一些不良反应，如头痛、头晕、血压升高等，使用时需要谨慎评估患者情况，在医生指导下使用。