治疗勃起性功能障碍的药物主要有以下几类。目前常用的有磷酸二酯酶5抑制剂，这类药物中的西地那非，临床应用较为广泛，一般来说在性活动前约1小时服用，能帮助改善勃起功能。
磷酸二酯酶5抑制剂类
他达拉非： 其作用持续时间相对较长，有的患者服用后药效可维持36小时左右，适用于有计划性性行为的患者。它通过抑制磷酸二酯酶5的活性，增加阴茎海绵体血流，从而改善勃起功能。西地那非： 是较早应用的此类药物，一般在性活动前0.5 - 4小时服用都有效果，能快速促进阴茎勃起，帮助患者进行正常的性行为。
雄激素类药物
对于因雄激素缺乏导致勃起功能障碍的患者，可考虑使用雄激素类药物。比如十一酸睾酮胶丸，适用于雄激素水平低下引起的勃起功能障碍等情况。但需要注意的是，雄激素类药物有一定的禁忌证，如有前列腺癌或乳腺癌的患者禁用，且使用过程中需要监测相关指标。
中药类药物
一些中药也被用于改善勃起功能障碍，比如复方玄驹胶囊。它是由玄驹、淫羊藿、枸杞子、蛇床子等中药组成，具有温肾、壮阳、益精的作用，可用于肾阳虚型勃起功能障碍的辅助治疗，但起效相对可能没有西药那么快，需要长期服用观察效果。不过中药的疗效个体差异较大，使用时也需要在医生的指导下，根据患者的具体病情来合理应用。