男性小肚子疼可能由多种原因引起，比如泌尿系统问题，像膀胱炎，据统计，男性膀胱炎发病率相对较低，但一旦发病也会导致小肚子疼，同时可能伴有尿频、尿急等症状；还有肠道方面的问题，如肠炎，饮食不洁等可能引发肠炎，出现小肚子疼、腹泻等表现。
泌尿系统相关原因
膀胱炎： 除了小肚子疼，还可能出现排尿时尿道有灼热感，严重时可能有血尿。一般是细菌感染引起，比如大肠杆菌等病菌入侵膀胱导致炎症。前列腺炎： 多见于中青年男性，会有小腹部、会阴部疼痛，还可能出现尿频、尿急、尿不尽等症状。久坐、酗酒、长期憋尿等因素容易诱发前列腺炎。
肠道相关原因
肠炎： 若吃了变质、被污染的食物，很容易引发肠炎，除了小肚子疼，还会有腹泻症状，大便可能呈稀水样或黏液便。肠痉挛： 可能因腹部受凉、进食过多生冷食物等引起，表现为突然发作的小腹部阵发性疼痛，疼痛程度轻重不一，有时可自行缓解。
其他可能原因
腹股沟疝： 男性腹股沟疝也可能导致小肚子疼，表现为腹股沟区可复性肿块，站立、行走、咳嗽或劳动时出现，平卧休息或用手推送时肿块可回纳腹腔。输尿管结石： 会出现突然发作的剧烈小腹部疼痛，疼痛可向会阴部放射，同时可能伴有血尿，疼痛发作时患者往往难以忍受。