男性小肚子疼可能由多种原因引起。比如，泌尿系统结石就可能导致小肚子疼，像输尿管结石，疼痛可能较为剧烈，呈绞痛样，有时还会伴有血尿等症状。
泌尿系统相关原因
输尿管结石： 当结石在输尿管内移动时，会刺激输尿管黏膜，引起小腹部剧烈疼痛，疼痛可向会阴部放射。患者可能还会出现恶心、呕吐等症状。膀胱炎： 男性膀胱炎也会引发小肚子疼，一般还伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状，尿液可能会浑浊，严重时可能出现血尿。
肠道方面的原因
肠炎： 细菌、病毒感染等引起的肠炎会导致小肚子疼，常伴有腹泻症状，腹泻严重时可能出现脱水表现，如口干、尿少等。例如细菌性肠炎，多是由于食用了被细菌污染的食物引起。肠痉挛： 饮食不当、腹部着凉等可能引发肠痉挛，表现为突然发作的小腹部阵发性疼痛，疼痛程度不一，可自行缓解。
男性生殖系统原因
前列腺炎： 慢性前列腺炎患者可能会出现小肚子疼的情况，还常伴有会阴部不适、尿频、尿急、尿不尽等症状，尤其在久坐、饮酒后症状可能加重。附睾炎： 附睾炎也会导致阴囊部位疼痛，疼痛可放射至小腹部，同时附睾会肿大、疼痛，患者可能伴有发热等全身症状。