怀孕三个月突然肚子疼可能由多种原因引起。比如，生理性腹痛较为常见，这是因为怀孕后子宫逐渐增大，韧带受到牵拉，一般疼痛比较轻微，持续时间短。但也可能是病理性因素导致，像先兆流产，这种情况可能伴有阴道少量流血，需要引起重视。
一、先兆流产相关
子宫收缩导致腹痛： 先兆流产时，子宫会出现不规律收缩，从而引起肚子疼。这种收缩可能一开始不规律，疼痛程度因人而异，有的孕妇可能感觉像月经来潮时的隐痛。伴随阴道出血： 部分先兆流产的孕妇除了肚子疼，还会有阴道少量出血的情况，出血量一般少于月经量。
二、宫外孕相关
腹痛特点： 宫外孕破裂或流产时会出现肚子疼，通常是一侧下腹部撕裂样疼痛，疼痛比较剧烈，同时可能伴有肛门坠胀感。其他伴随症状： 还可能出现阴道不规则出血，出血量一般不多，但颜色暗红。
三、肠道问题导致
肠痉挛： 孕妇饮食不当，比如吃了过多生冷、刺激性食物，可能引起肠痉挛，导致肚子疼，疼痛一般是阵发性的，部位多在脐周。急性肠炎： 如果吃了不洁食物，可能患上急性肠炎，除了肚子疼，还可能伴有腹泻、恶心、呕吐等症状，肚子疼的程度和腹泻次数有关，腹泻严重时可能加重腹痛。
四、泌尿系统问题
输尿管结石： 怀孕后由于激素变化等原因，可能引发输尿管结石，导致一侧腰部或下腹部剧烈疼痛，疼痛难以忍受，还可能伴有尿频、尿急、血尿等症状。肾盂肾炎： 孕妇如果发生肾盂肾炎，也会出现肚子疼，多为一侧腰部胀痛，同时可能伴有发热、寒战等全身症状。