胃肠紊乱的症状较多，常见的有消化不良，约有30% - 50%的胃肠紊乱患者会出现餐后饱胀、早饱等消化不良表现。
胃肠道相关症状
腹痛： 多数患者会有腹痛情况，疼痛部位不固定，一般为隐痛、胀痛等。比如有的患者腹痛没有明显规律，程度轻重不一，可能持续几分钟到几小时不等。腹胀： 胃肠紊乱时胃肠蠕动功能可能异常，容易出现腹胀，尤其是进食后腹胀感更明显，有时肚子会看起来鼓鼓的。
全身伴随症状
恶心呕吐： 部分胃肠紊乱患者会有恶心感觉，严重时可能出现呕吐，呕吐物多为胃内的容物，一般没有血性物质，但频繁呕吐可能导致脱水等情况。疲劳乏力： 由于胃肠功能紊乱影响营养吸收等，患者可能会感觉疲劳乏力，精神状态欠佳，影响日常生活和工作。
其他表现
排便异常： 有的患者会出现腹泻，大便次数增多，质地较稀，可能一天数次；也有的患者会出现便秘，排便困难，大便干结，间隔时间较长才排便一次。情绪改变： 胃肠紊乱还可能影响情绪，部分患者会出现焦虑、抑郁等情绪变化，而情绪不好又可能反过来加重胃肠紊乱，形成一种恶性循环。