早晚咳嗽可能由多种原因引起。比如，过敏性咳嗽比较常见，过敏原如灰尘、花粉等在早晚空气相对稳定时容易被吸入，刺激呼吸道引发咳嗽。一般来说，这类咳嗽可能持续数周甚至更久。
一、呼吸道感染因素
上呼吸道感染后咳嗽： 即使急性感染症状好转，部分人仍会在早晚出现咳嗽，这是因为呼吸道黏膜受损修复需要时间，通常可能持续3 - 8周左右。比如病毒引起的上呼吸道感染后，气道反应性增高，早晚气温变化时就容易咳嗽。支气管炎： 急性支气管炎患者也常出现早晚咳嗽。细菌或病毒感染支气管后，炎症刺激使得支气管分泌物增多，早晚平卧时分泌物刺激气道，咳嗽会更明显。一般急性支气管炎经过规范治疗，咳嗽可能在1 - 3周内缓解，但如果转为慢性支气管炎，咳嗽会反复，早晚咳嗽也会持续存在。
二、气道高反应性因素
咳嗽变异性哮喘： 这是一种特殊类型的哮喘，主要表现为咳嗽，早晚咳嗽较为突出。气道存在高反应性，对冷空气、异味等刺激敏感，当早晚气温降低或接触到过敏原等刺激物时，就会引发咳嗽。患者可能需要长期规范治疗来控制气道炎症，减少早晚咳嗽发作。嗜酸细胞性支气管炎： 气道内嗜酸细胞浸润，导致气道炎症，引起早晚咳嗽。这种情况需要通过检查如诱导痰细胞学等确诊，一般需要使用糖皮质激素等药物来减轻气道炎症，从而缓解早晚咳嗽症状。
三、环境因素
空气干燥： 早晚空气湿度相对较低，尤其是在秋冬季节，室内如果没有适当加湿，干燥的空气会刺激呼吸道黏膜，引发咳嗽。建议在室内使用加湿器，将空气湿度保持在40% - 60%左右，可减轻早晚因空气干燥引起的咳嗽。空气污染： 城市中早晚的交通尾气、工业污染物等可能在空气中积聚，当吸入这些污染空气时，会刺激呼吸道，导致早晚咳嗽。例如在雾霾天气时，空气中的颗粒物等会刺激呼吸道，使咳嗽加重，此时尽量减少早晚外出，或佩戴防护口罩。