眼睛结膜炎的原因有多种。其中感染因素是常见原因之一，比如细菌感染，像金黄色葡萄球菌等细菌感染眼部就可能引发结膜炎，据统计，细菌性结膜炎在结膜炎患者中占比较大；病毒感染也是重要因素，常见的有腺病毒等，腺病毒引起的病毒性结膜炎具有较强传染性。
感染性因素导致
细菌感染： 很多细菌都可能成为结膜炎的致病源，像肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等感染眼部结膜后，会引发炎症反应，出现眼睛红肿、分泌物增多等症状。病毒感染： 除了腺病毒，肠道病毒等也能引起结膜炎，由病毒导致的结膜炎往往发病较急，患者会有眼睛刺痛、怕光、流泪等表现。
非感染性因素导致
过敏因素： 过敏体质的人接触过敏原后易引发结膜炎，常见的过敏原如花粉、尘螨、动物毛发等，当眼部接触到这些过敏原时，免疫系统会做出反应，导致结膜过敏发炎，出现眼睛瘙痒、红肿等症状。物理刺激： 比如风沙、烟尘等刺激眼部，或者长期佩戴隐形眼镜不注意清洁护理，都可能刺激结膜引发炎症。长期佩戴隐形眼镜的人群，如果不按照规定护理镜片，就容易让结膜受到刺激而发炎。化学物质刺激： 像眼药水、化妆品、烟雾等中的化学物质接触到眼睛，也会刺激结膜，引起结膜炎，例如某些不合格的化妆品可能含有刺激成分，接触眼部后就可能导致结膜发炎。