眼睛结石通常是由眼部慢性炎症长期刺激引起的。比如，当眼睛长期受到沙眼、慢性结膜炎等炎症影响时，睑结膜上皮细胞的代谢产物和变性的白细胞堆积在一起，就容易形成眼睛结石。
眼部慢性炎症因素
沙眼导致：沙眼是由沙眼衣原体感染引起的一种慢性传染性结膜角膜炎。在沙眼病程中，结膜会出现乳头增生、滤泡形成等病变，同时睑结膜的上皮细胞会不断更新，当代谢产物和炎症细胞等堆积，就为眼睛结石的形成创造了条件。据统计，有沙眼病史的人群中眼睛结石的发生率相对较高。慢性结膜炎引发：慢性结膜炎的病因较多，如细菌感染、不良环境刺激（灰尘、烟雾等）、长期佩戴隐形眼镜等。炎症持续刺激结膜，使得结膜细胞发生病变，进而容易形成眼睛结石。长期处于污染环境中的人群，患慢性结膜炎进而出现眼睛结石的风险会增加。
眼部卫生不佳因素
不注意用眼卫生：如果平时经常用手揉眼睛，手上的细菌等病原体就容易进入眼睛，引发眼部炎症，增加眼睛结石形成的可能性。比如，用脏手揉眼睛后，细菌等微生物感染结膜，长期下去就可能导致眼睛结石。眼部清洁不到位：长期不清洁眼部，眼部的分泌物、灰尘等堆积，也会刺激结膜，诱发炎症，从而促进眼睛结石的形成。例如，长时间不洗脸、不清洗眼部的人，更容易出现眼部相关问题，包括眼睛结石。
年龄相关因素
老年人易患：随着年龄增长，老年人的眼部组织会逐渐发生退行性变化，睑结膜的代谢功能也会下降，更容易出现上皮细胞堆积等情况，进而增加眼睛结石的发生几率。一般来说，50岁以上的老年人相对更易长眼睛结石。儿童也可能出现：虽然儿童患眼睛结石相对较少，但如果儿童眼部有长期的炎症刺激，比如长期患过敏性结膜炎等，也可能出现眼睛结石。不过儿童眼睛结石的发生概率远低于老年人。