新生儿母乳性黄疸是指与母乳喂养相关的特发性黄疸，通常认为可能与母乳中的某些物质有关。一般来说，其发生机制可能与母乳中的β-葡萄糖醛酸苷酶水平较高有关，这种酶会使肠道内的结合胆红素重吸收增加，从而导致黄疸。
母乳成分相关因素
母乳中β-葡萄糖醛酸苷酶作用： 母乳中的β-葡萄糖醛酸苷酶含量较高，它能分解肠道内的结合胆红素，使其重新变为未结合胆红素，而未结合胆红素可通过肠肝循环被重新吸收进入血液，使得血液中未结合胆红素水平升高，引发黄疸。一般这种情况在母乳喂养的新生儿中较为常见，尤其在出生后1 - 3周左右容易出现。母乳中脂肪酶影响： 母乳中的脂肪酶也可能对新生儿胆红素代谢有一定影响。有研究发现，母乳中的脂肪酶可能会干扰胆红素的正常代谢过程，虽然具体机制还在进一步研究中，但它也是导致母乳性黄疸的一个相关因素。
新生儿自身代谢特点
肠道菌群建立不完善： 新生儿出生后肠道菌群尚未完全建立，正常肠道菌群有助于将结合胆红素转化为粪胆原排出体外。而母乳性黄疸的新生儿肠道菌群建立相对缓慢，导致结合胆红素的排泄途径受阻，从而使胆红素在体内积聚，引发黄疸。一般出生后1周内肠道菌群建立不完善的情况相对更明显，此时母乳性黄疸的发生风险可能相对较高。肝酶活性不足： 新生儿肝脏中的尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UGT）活性相对不足，这种酶是将未结合胆红素转化为结合胆红素的关键酶。由于肝酶活性不足，未结合胆红素转化为结合胆红素的能力受限，使得未结合胆红素在体内堆积，进而引发母乳性黄疸。一般出生后前几周肝酶活性都处于逐渐上升的过程，所以这个阶段母乳性黄疸相对常见。
母乳喂养方式因素
喂养频率不足： 如果新生儿母乳喂养频率较低，比如每天喂养次数少于8 - 12次，那么新生儿摄入的母乳量就会相对较少，导致胎便排出延迟。而胎便中含有大量的胆红素，胎便排出延迟会使胆红素通过肠肝循环重吸收增加，从而增加母乳性黄疸的发生风险。一般建议新生儿每天母乳喂养次数应保证在8次以上，以促进胎便排出。喂养不足导致摄入热量低： 新生儿摄入热量不足时，会使肠道蠕动减慢，胆红素的排泄也会受到影响。同时，热量不足还可能导致肝酶活性进一步降低，使得未结合胆红素转化为结合胆红素的能力更弱，从而更容易引发母乳性黄疸。所以保证新生儿充足的母乳喂养量，摄入足够热量很重要，一般新生儿每天需要摄入足够的热量来维持正常的代谢和胆红素排泄。