减肥辟谷对身体通常有一定伤害。一般来说，短期的辟谷可能会导致身体营养摄入不足，比如连续3天以上的过度辟谷，会使人体缺乏蛋白质、维生素、矿物质等必需营养成分。
营养方面的伤害
能量供应不足：辟谷期间，人体摄入的能量大幅减少，身体会动用储存的脂肪来供能，但如果长期辟谷，脂肪分解产生的酮体可能会在体内堆积，引发酮症，出现恶心、呕吐等不适症状。一般连续辟谷超过5天，就较易出现这种情况。营养缺乏：辟谷会导致多种营养素缺乏，像长期辟谷的人容易缺乏铁元素，从而引发贫血，出现头晕、乏力等症状；还可能缺乏维生素C，导致免疫力下降，容易生病。
消化系统的伤害
胃肠功能紊乱：辟谷时胃肠蠕动减缓，长期如此会使胃肠消化功能减退。例如，辟谷1周以上，可能会出现消化不良、便秘等问题。而且突然恢复正常饮食时，胃肠难以适应，容易引发腹泻等症状。胆囊问题：长期辟谷会影响胆汁的正常分泌和排泄，增加胆结石的发病风险。因为胆汁长期储存，浓度升高，易形成结晶，进而发展为结石。
代谢方面的伤害
基础代谢率下降：身体长期处于低能量摄入状态，会触发自我保护机制，降低基础代谢率。当恢复正常饮食后，即使摄入与辟谷前相同的热量，也更容易导致体重反弹，甚至比之前更胖。一般基础代谢率可能会下降10%~20%。内分泌失调：辟谷会影响激素的分泌，比如甲状腺激素分泌减少，导致身体代谢减慢；还可能影响胰岛素的敏感性，增加患糖尿病的潜在风险。