两个月来了三次大姨妈可能由以下原因引起：
1.内分泌紊乱：如果女性长期压力过大、精神紧张或作息不规律，可能导致内分泌紊乱，影响激素水平，从而出现月经异常。此外，一些疾病，如多囊卵巢综合征、甲状腺功能亢进等，也可能导致内分泌紊乱。
2.器质性病变：生殖器官局部的炎症、肿瘤及发育异常、颅内疾患、其他内分泌功能失调如甲状腺、肾上腺皮质功能异常、糖尿病、席汉氏病等均可导致大姨妈异常。
3.药物影响：服用某些药物，如避孕药、抗抑郁药等，可能会影响激素水平，导致月经失调。
4.节育环：节育环也可能引起大姨妈异常，表现为月经量过多、经期延长或月经间期出血等。
如果出现两个月来了三次大姨妈的情况，建议及时就医，进行相关检查，如性激素六项、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，保持良好的生活习惯，注意休息和饮食，有助于调节月经。