肠套叠的治疗方法主要包括非手术治疗和手术治疗。对于早期的肠套叠，空气灌肠复位是常用的非手术治疗方法，约80%的原发性肠套叠患儿可通过空气灌肠复位成功，一般在发病48小时内进行空气灌肠复位效果较好。
非手术治疗方式
空气灌肠复位： 通过肛门注入空气，利用空气的压力将套叠的肠管复位。一般要求在发病6-12小时内，患儿全身情况良好时进行。空气灌肠复位时要密切观察患儿情况，若复位失败则需考虑手术治疗。钡剂灌肠复位： 与空气灌肠类似，也是将钡剂通过肛门注入肠道，利用钡剂的压力使套叠肠管复位。但现在空气灌肠应用更广泛，因为钡剂灌肠有一定风险，如钡剂残留等问题。
手术治疗情况
肠套叠时间较长： 当肠套叠超过48-72小时，或者空气灌肠、钡剂灌肠复位失败，以及怀疑有肠坏死的情况时，需要进行手术治疗。手术中会查看套叠肠管的情况，如果肠管没有坏死，可以进行手法复位；如果肠管已经坏死，则需要切除坏死的肠管，并进行肠吻合术。复发性肠套叠： 对于复发性的肠套叠，也多需要手术治疗来明确病因并进行相应处理。手术时要仔细检查肠道，寻找可能导致肠套叠复发的因素，如肠息肉、梅克尔憩室等，并进行针对性处理。
治疗后的注意事项
观察患儿情况： 无论是非手术治疗还是手术治疗后，都要密切观察患儿的精神状态、腹痛情况、大便性状等。如果患儿出现腹痛加剧、呕吐、便血等情况，要及时告知医生。饮食调整： 非手术治疗复位成功后，一般需要先禁食一段时间，然后逐渐恢复饮食，从流质饮食开始，如米汤等，慢慢过渡到半流质饮食和普通饮食。手术治疗后，饮食恢复时间会根据手术情况而定，开始时也是从少量流质饮食开始，逐渐增加饮食量和改变饮食种类。定期复查： 出院后要按照医生的要求定期带患儿复查，一般会进行腹部超声等检查，以了解肠道恢复情况，确保没有复发等异常情况。