男性不孕不育的原因较多，其中约有10%-15%的夫妻存在生育问题，而男性因素占了一半左右。
一、生殖系统疾病因素
先天性生殖系统异常： 有些男性出生时就存在生殖系统的先天性异常，比如先天性睾丸发育不全综合征，患者的染色体核型多为47，XXY，会出现睾丸小而硬、身材修长等表现，影响精子的生成。精索静脉曲张： 这是较为常见的导致男性不育的原因。精索静脉曲张是指阴囊内精索静脉迂曲扩张，它会使睾丸局部温度升高，影响睾丸的生精功能，大约有35%的男性不育症是由精索静脉曲张引起的。患者可能会感觉到阴囊坠胀不适，但也有很多人没有明显症状，需要通过超声检查来发现。
二、内分泌因素
下丘脑-垂体病变： 下丘脑或垂体发生病变会影响性激素的分泌，从而影响生精功能。例如垂体瘤，垂体瘤可能会分泌异常的激素，干扰正常的生殖内分泌轴。如果是泌乳素瘤，患者可能会出现泌乳素升高，同时伴有性欲减退、勃起功能障碍等表现。甲状腺疾病： 甲状腺功能亢进或减退都会影响生殖内分泌。甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，可能会导致精子生成减少、活力下降；甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，也会影响性激素的正常分泌，进而影响生育。
三、免疫因素
自身免疫性睾丸炎： 男性自身的免疫系统可能会错误地攻击自身的睾丸组织，引发自身免疫性睾丸炎，破坏睾丸的生精功能和间质细胞功能，导致精子产生减少或质量下降。抗精子抗体阳性： 男性的免疫系统产生了抗精子抗体，这些抗体可能会黏附在精子表面，影响精子的活力、运动能力甚至导致精子凝集，从而阻碍精子与卵子结合，造成不育。大约有5%-10%的不育男性存在抗精子抗体阳性的情况。
四、生活方式与环境因素
不良生活习惯： 长期吸烟、酗酒会影响男性的生殖健康。吸烟中的尼古丁等有害物质会影响精子的生成和活力，长期大量酗酒会导致睾丸萎缩，影响生精功能。有研究表明，每天吸烟超过20支的男性，其精子质量明显低于不吸烟者。环境因素： 长期接触某些有害物质也会导致男性不育。比如长期接触重金属铅、汞等，或者长期处于高温环境中，像一些高温作业的工人，睾丸局部温度升高，会影响精子的生成。另外，长期暴露在有辐射的环境中，也可能会损伤精子的遗传物质，影响生育能力。