早上起来眼睛肿可能由睡觉时头部过低、眼睛过度疲劳、结膜炎等因素导致，应根据具体原因对症治疗。
一、睡觉时头部过低：眼皮组织疏松，组织间液易聚集在眼睑下。当睡觉时头部位置过低，易引起体位水肿，早上表现为眼皮肿胀，身体一般无其他不良反应。对此，无需药物治疗，可适当调整睡眠习惯，如尽量垫高枕头。通常起床后约半小时至一小时，症状会缓解。
二、眼睛过度疲劳：这也是早上眼睛肿的原因之一。若晚上睡觉太晚、经常熬夜、过度用眼，会使眼睛处于疲劳状态，从而早上出现水肿。可通过局部热敷和按摩来缓解水肿，同时要调整好生活习惯，避免经常熬夜和过度用眼。
三、结膜炎：早上眼睛肿还可能是患上结膜炎，多因炎症刺激引起，与不注重眼部卫生清洁有一定关系。可在医生指导下外用妥布霉素滴眼液、环丙沙星滴眼液等药物进行治疗。
总之，早上起来眼睛肿有多种原因，要明确具体原因后采取针对性的措施进行改善和治疗。