脚趾甲不光滑凹凸不平可能由多种原因导致，如灰指甲、甲营养不良等，可通过不同方式进行治疗。
一、灰指甲：
1.病因：由皮肤癣菌侵犯甲板或甲床引起的甲病变。
2.症状表现：甲板会出现浑浊、变厚、变脆，还有凹凸不平、变色等，若不控制，可能出现甲板脱落。
3.治疗方法：可局部涂抹盐酸特比萘芬乳膏、硝酸咪康唑软膏等；若病情未缓解，可进行拔甲或病甲清除术。
二、甲营养不良：
1.病因：指甲板正常形成过程受影响。
2.症状表现：脚趾甲可能变薄、变厚、易碎、凹凸不平、粗糙等，部分患者还可能伴随湿疹、扁平苔藓等疾病出现。
3.治疗方法：可局部使用他克莫司软膏、卡泊三醇乳膏等，若指甲有凹凸不平情况，可通过美甲改善甲营养不良造成的甲面外观。
在恢复期间要做好局部清洁卫生，防止细菌感染。总之，当发现脚趾甲不光滑凹凸不平时，应及时明确原因，并采取针对性的治疗措施。