三个月不来月经且没怀孕可能是由多种因素引起的，常见的治疗方式包括药物治疗、手术治疗以及生活调理等，医生会依据具体病情和患者身体状况等来确定合适的治疗方法。
一、药物治疗：
1.若经性激素检查或超声检查后判断是由于卵巢功能紊乱导致的，可遵循医嘱使用如黄体酮胶丸或氯米芬片等药物，也可进行肌肉注射尿促性素。
二、手术治疗：
1.倘若通过超声或腹腔镜检查明确是卵巢囊肿、子宫发育畸形等情况，可采取手术治疗，像卵巢囊肿剥离术、子宫矫形术等。
三、生活调理：
1.许多患者因为学习或工作压力大、精神紧张等，容易引发内分泌紊乱，进而出现三个月不来月经的状况。针对这种情况，建议患者要养成良好的生活习惯，切不可熬夜，应做到早睡早起；要合理安排膳食以保持营养均衡；适当进行体育锻炼；保持积极向上的乐观心态。
总之，患者应尽早就诊，咨询医生并完善相关检查，明确病因后积极配合医生进行处理。