胆管结石的治疗需根据具体情况选择，一般来说，对于无症状的胆管结石，可定期观察；而有症状或出现并发症的胆管结石，多需手术等治疗。通常手术治疗是比较有效的方式，比如腹腔镜胆总管切开取石术，术后恢复相对较快，多数患者可在1 - 2周左右基本恢复正常生活。
药物治疗情况
对症药物： 当胆管结石引起疼痛时，可使用解痉止痛药物，如山莨菪碱等，能缓解胆管痉挛带来的疼痛，但这只是暂时缓解症状，并不能去除结石。不过药物治疗主要是作为辅助手段，单独靠药物很难彻底清除胆管结石。
手术治疗方式
腹腔镜胆总管切开取石术： 这是较为常用的手术方法，通过在腹部打几个小孔，插入腹腔镜和手术器械，切开胆总管取出结石。这种手术创伤相对较小，术后恢复较快，一般住院时间在7 - 10天左右。胆肠吻合术： 如果胆管存在狭窄等情况，可能需要做胆肠吻合术，将胆管与肠道吻合，使胆汁引流通畅。但该手术相对复杂一些，术后需要注意防止吻合口瘘等并发症。
内镜治疗方法
内镜逆行胰胆管造影（ERCP）： 可以通过口腔、食管、胃到达十二指肠，找到胆管开口，插入导管，注入造影剂明确结石位置后，用取石网篮等取出结石。这种方法对于合适的胆管结石患者是一种微创的治疗方式，不需要开刀，术后恢复也比较快，一般住院3 - 5天即可。不过并非所有胆管结石都适合这种方法，需要医生评估结石的大小、位置等情况。