肠化生通常没有很典型、特异的症状，部分人可能会有上腹部隐痛、胀满、反酸、嗳气等消化不良的表现。不过也有不少人可能完全没有明显症状。
症状表现不典型
肠化生是胃黏膜上皮细胞被肠型上皮细胞所代替，也就是胃黏膜中出现了类似小肠或大肠黏膜的上皮细胞。很多时候，单纯的肠化生本身不会引发特别明显、特异性很强的症状。有些人可能偶尔会感觉上腹部隐隐作痛，疼痛程度一般比较轻，持续时间也不定；也有人会有上腹部胀满感，进食后可能更明显；还可能出现反酸、嗳气等情况，但这些症状其实在很多胃部其他情况中也可能出现，并不具有特异性。
与基础胃病相关的症状
肠化生往往是在慢性胃炎等基础胃病的基础上发生的。如果是由幽门螺杆菌感染引起的慢性胃炎伴有肠化生，那可能除了上述不典型症状外，还可能有食欲减退的表现。另外，如果同时合并有胃溃疡等情况，可能疼痛会更有规律，比如在进食后一段时间出现疼痛等，但这也不是肠化生特有的。
症状轻重个体差异大
不同人的肠化生情况不同，症状表现差异很大。有些肠化生程度较轻的人，可能几乎没有任何自觉症状，只是在胃镜检查并进行病理活检时才被发现；而有些肠化生程度相对较重的人，可能症状会相对明显一些，但总体来说，其症状都不是很特异，不能仅仅依靠症状来判断是否有肠化生，还需要通过胃镜检查结合病理活检来明确诊断。