孕酮降低可能由多种原因引起。一般来说，女性在怀孕早期，如果孕酮值低于25ng/ml，就需要警惕孕酮降低的情况。
内分泌系统问题导致
黄体功能不全：卵巢的黄体是分泌孕酮的重要结构，如果黄体功能出现问题，就会使得孕酮分泌减少。比如一些内分泌失调的女性，黄体期缩短，就可能引发孕酮降低。垂体功能减退：垂体能够分泌促性腺激素等，来调节卵巢的功能。当垂体功能减退时，促性腺激素分泌不足，会影响卵巢分泌孕酮，从而导致孕酮降低。
胚胎因素相关
胚胎发育异常：在怀孕早期，若胚胎本身发育不良，比如染色体异常等情况，会影响胎盘分泌孕酮，进而出现孕酮降低的现象。有研究发现，约有50% - 60%的自然流产与胚胎染色体异常有关，而这类情况往往伴随孕酮降低。宫外孕：宫外孕时，胚胎着床在子宫以外的部位，如输卵管等，由于着床部位的特殊性，不能像正常宫内妊娠那样维持良好的孕酮分泌，会导致孕酮水平低于正常宫内妊娠时的水平。
其他因素影响
不良生活方式：长期熬夜、过度劳累等不良生活方式可能影响内分泌平衡，从而影响孕酮的分泌。比如长期熬夜的女性，内分泌紊乱的概率增加，可能导致孕酮降低。某些疾病影响：一些甲状腺疾病等也可能间接影响孕酮的分泌，导致孕酮水平降低。例如甲状腺功能减退的患者，体内激素调节失衡，可能会波及孕酮的分泌情况。