引起小便疼痛的原因包括泌尿系统感染、泌尿系统结石、泌尿系统外伤以及导尿治疗后拔除导尿管时。应根据具体原因进行合理治疗。
一、泌尿系统感染：当有细菌感染尿道时，会导致尿道黏膜充血水肿甚至损伤。此时在上厕所时，尿液流经损伤的尿道黏膜便会产生刺痛感。对于尿道感染，首先可大量饮水以增加尿量，排尿时可冲洗尿道分泌物。还可依据细菌培养和药敏试验来选择有效的抗生素进行抗菌治疗。
二、泌尿系统结石：由于结石阻碍了尿道，小便时就会出现刺痛、排尿困难以及尿分叉等情况。如果结石较小且无明显嵌顿，可大量饮水并进行跳跃动作，以利于结石排出。合并感染时可应用敏感抗菌药物。若结石引起梗阻而影响排尿，或经非手术治疗无效，应考虑手术内镜下碎石或取石。
三、泌尿系统外伤：这些外伤可能会使尿道黏膜受损，进而出现血尿或排尿刺痛。一般的小挫伤，患者多喝水并口服抗生素预防感染即可。如果是尿道部分裂伤导致患者排尿困难，通常可以留置导尿管进行治疗。
四、导尿治疗后：在行导尿治疗后拔除导尿管的前几次小便，也会出现刺痛现象，这种情况无需特殊治疗，病人多喝水，随着排尿次数的增加，刺痛会逐渐缓解直至消失。
总之，针对小便疼痛，要准确判断原因，然后采取相应的治疗措施，以有效缓解症状。