治疗直肠炎的药物有多种，常见的如氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，它可以通过在肠道内分解为磺胺吡啶和 5-氨基水杨酸，发挥抗炎作用，一般用药需遵循一定疗程。
氨基水杨酸制剂类
柳氮磺吡啶： 是治疗轻、中度直肠炎的常用药物之一，它能抑制炎症介质的产生，从而减轻直肠的炎症反应。美沙拉嗪： 也是氨基水杨酸制剂的一种，有多种剂型，如栓剂、肠溶片等，对于直肠炎患者，直肠给药的美沙拉嗪栓剂可以直接作用于直肠病变部位，局部抗炎效果较好，能缓解直肠炎引起的腹泻、黏液脓血便等症状。
糖皮质激素制剂类
氢化可的松琥珀酸钠： 对于病情较重的直肠炎患者，可采用局部灌肠的方式使用氢化可的松琥珀酸钠，它能迅速减轻炎症反应，缓解患者的不适症状，但长期使用可能会有一些副作用，需要在医生的严格监测下使用。布地奈德： 局部应用布地奈德也可用于直肠炎的治疗，它是一种强效的糖皮质激素，局部作用强，全身副作用相对较小，能有效减轻直肠的炎症水肿等情况。
益生菌类
双歧杆菌四联活菌片： 直肠炎患者肠道菌群往往失调，补充双歧杆菌四联活菌片等益生菌，可以调节肠道菌群平衡，改善肠道微生态环境，有助于直肠黏膜的修复和炎症的消退。枯草杆菌二联活菌颗粒： 该益生菌制剂能补充肠道有益菌，抑制有害菌的生长繁殖，对于直肠炎导致的肠道功能紊乱有一定的调节作用，促进肠道恢复正常的生理功能。直肠炎的治疗药物选择需要根据患者的具体病情、病变程度等因素来综合决定，患者应在医生的指导下合理用药，同时还需注意饮食等一般治疗措施的配合，以促进病情的好转。