附件囊肿有可能会自行消失，具体原因和影响如下：
1.生理原因：
滤泡囊肿：为最常见的附件囊肿，多为单侧，直径一般在5厘米以下，壁薄，可自行吸收。
黄体囊肿：多为单侧，直径一般不超过4厘米，囊壁薄，可在月经后自行消失。
2.病理原因：
巧克力囊肿：是子宫内膜异位症的一种病变，可逐渐增大，不易自行消失，还可能导致痛经、性交痛、月经异常等症状。
畸胎瘤：是一种卵巢生殖细胞肿瘤，多为良性，少数可发生恶变，一般不会自行消失，需要手术治疗。
3.治疗方法：
观察：对于直径小于5厘米、无明显症状的附件囊肿，可定期复查，观察其大小变化。
药物治疗：对于内分泌失调引起的附件囊肿，可使用药物调节激素水平，促使囊肿缩小或消失。
手术治疗：对于直径大于5厘米、有明显症状或怀疑恶变的附件囊肿，应手术治疗，切除囊肿。
需要注意的是，附件囊肿的类型和原因较为复杂，部分囊肿可能会自行消失，也可能会持续存在或逐渐增大。因此，发现附件囊肿后，应及时就医，明确诊断，并根据具体情况选择合适的治疗方法。