子宫附件囊肿是否会自己消失，需要根据囊肿的性质、大小、症状等因素来判断。一般来说，以下情况可能会导致子宫附件囊肿消失：
1.生理性囊肿：如滤泡囊肿和黄体囊肿，多为单侧，直径一般小于5厘米，壁薄，可在月经干净后自行消失。
2.炎症性囊肿：如输卵管积水、卵巢脓肿等，多由盆腔炎性疾病引起。较小的囊肿经过积极的抗感染治疗后，可能会缩小或消失。
3.子宫内膜异位囊肿：即巧克力囊肿，较小的囊肿可能会随着时间的推移逐渐萎缩，但较大的囊肿通常需要手术治疗。
需要注意的是，以下情况子宫附件囊肿不会自己消失：
1.真性肿瘤：如卵巢浆液性囊腺瘤、黏液性囊腺瘤、成熟畸胎瘤等，一旦形成，不会自行消失，需要手术治疗。
2.瘤样病变：如卵巢冠囊肿、输卵管系膜囊肿等，一般也不会自行消失，通常需要手术切除。
3.其他情况：如卵巢巧克力囊肿较大、卵巢恶性肿瘤等，更不会自行消失，需要尽快治疗。
总之，发现子宫附件囊肿后，应及时就医，医生会根据囊肿的具体情况制定合适的治疗方案。大多数情况下，子宫附件囊肿是可以治愈的，患者不必过于担心。但如果囊肿持续存在、增大或出现腹痛、月经异常等症状，应及时复诊，以便调整治疗方案。