男人小便射精疼痛的原因可能有以下几点：
1.感染：如尿道炎、前列腺炎、精囊炎等，炎症会导致尿道黏膜充血、水肿，射精时刺激这些部位，引起疼痛。
2.结石：前列腺结石、尿道结石等可导致射精疼痛，结石刺激尿道或射精管，引起疼痛。
3.损伤：性生活过于频繁、过猛，或手淫时用力不当，可导致尿道或射精管损伤，引起疼痛。
4.梗阻：前列腺增生、尿道狭窄等可导致尿道梗阻，排尿不畅，射精时阻力增加，引起疼痛。
5.肿瘤：前列腺癌、尿道癌等肿瘤可侵犯周围组织，引起疼痛。
6.其他：精索静脉曲张、附睾炎、包茎等也可能导致射精疼痛。
如果出现小便射精疼痛的情况，建议及时就医，进行相关检查，如尿液检查、前列腺液检查、超声检查等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，要注意个人卫生，避免不洁性生活，保持尿道口清洁。