打喷嚏头疼可能是多种原因引起的，比如打喷嚏时头部压力变化可能导致头疼，一般这种情况多是短暂出现。
鼻腔压力变化引发
打喷嚏时气流冲击： 当人打喷嚏时，鼻腔内会产生较大的气流冲击，这种气流冲击可能会影响到头部的压力平衡。比如剧烈打喷嚏时，鼻腔内压力迅速变化，可能会传导到头部，引起头部神经、血管的短暂性牵拉或刺激，从而导致头疼。一般这种因打喷嚏瞬间压力变化引起的头疼，持续时间较短，可能几分钟内就会缓解。鼻 - 颅反射机制： 鼻腔和头部的神经存在一定的关联反射。鼻腔黏膜的神经受到刺激引发打喷嚏时，可能通过神经反射影响到头部的神经结构，进而引发头疼。例如鼻腔的三叉神经等感觉神经受到刺激后，可能会通过神经传导通路影响到头部相关区域的神经功能，导致头疼出现。
本身存在头部基础问题
偏头痛患者： 本身有偏头痛病史的人，打喷嚏时更容易诱发头疼。因为偏头痛患者的脑部血管和神经对刺激比较敏感，打喷嚏这种突然的头部压力变化或神经刺激，可能会触发偏头痛的发作。比如有研究发现，部分偏头痛患者在打喷嚏后，头疼症状会加重或直接诱发。鼻窦炎患者： 鼻窦炎患者的鼻窦部位本身存在炎症，打喷嚏时会加重鼻窦内的压力变化，同时炎症部位受到刺激，可能会牵扯到周围的神经，从而引发头疼。鼻窦炎患者的头疼往往还可能伴有鼻塞、流涕等症状，打喷嚏后头疼可能会更明显。例如慢性鼻窦炎患者，打喷嚏时鼻窦内压力波动，炎症刺激周围神经，导致头疼持续或加重。
身体过度应激反应
神经肌肉紧张： 打喷嚏时身体会有较为强烈的应激反应，可能导致颈部、头部的肌肉紧张。长时间的肌肉紧张会引起头疼。比如打喷嚏时身体突然用力，颈部和头部肌肉瞬间收缩，如果本身肌肉处于紧张状态，就会进一步加重这种紧张，进而引发头疼。这种情况下，适当放松颈部和头部肌肉，头疼可能会有所缓解。血压短暂波动： 打喷嚏时的应激可能会引起血压的短暂波动。对于一些血压调节不太稳定的人，血压的波动可能会影响脑部的血液供应，从而导致头疼。比如本身有高血压倾向或血压调节功能较弱的人，打喷嚏后血压瞬间变化，脑部供血异常，就可能出现头疼症状。