支原体和衣原体是两类不同的微生物。支原体是一类没有细胞壁的原核微生物，大小一般在0.3~0.5微米之间；衣原体是一类严格细胞内寄生的原核微生物，直径约0.2~0.3微米。
支原体的特点
存在形式多样： 支原体可以在人体的多个部位定植，比如呼吸道、泌尿生殖道等。在呼吸道感染中，肺炎支原体是引起儿童和青少年社区获得性肺炎的常见病原体之一，约占社区获得性肺炎的10%~40%。致病机制： 支原体主要通过黏附、释放毒性物质等方式致病。肺炎支原体黏附在呼吸道上皮细胞表面，然后释放过氧化氢、核酸酶等毒性物质，损伤呼吸道上皮细胞，引起咳嗽、发热等肺炎相关症状。
衣原体的特点
不同类型致病： 沙眼衣原体是引起沙眼的主要病原体，也是性传播疾病中常见的病原体之一。鹦鹉热衣原体可引起鹦鹉热，这是一种人兽共患病。生活周期特殊： 衣原体有独特的生活周期，包括原体和始体两种形态。原体具有感染性，能吸附在宿主细胞表面，进入细胞后转化为始体，始体在细胞内分裂繁殖，最后又形成原体释放出去，感染新的细胞。
感染后的常见表现
呼吸道感染表现： 支原体引起的呼吸道感染，除了肺炎，还可能有咽炎、支气管炎等。患者常出现咳嗽，初期多为干咳，之后可能有少量黏痰，有的患者咳嗽较为剧烈，可持续较长时间。衣原体引起的呼吸道感染，如鹦鹉热，患者会出现发热、头痛、肌肉痛、咳嗽等症状，咳嗽多为干咳，严重时可出现呼吸困难。泌尿生殖道感染表现： 支原体、衣原体感染泌尿生殖道可引起非淋菌性尿道炎等疾病。男性患者可能出现尿道刺痒、尿频、尿痛，尿道分泌物少且稀薄；女性患者可能有尿道不适、白带增多、下腹隐痛等表现。