小腹正中最下面隐隐作痛可能由多种原因引起，比如女性生理期时，部分女性可能会有1 - 2天的轻微下腹隐痛，这是因为生理期子宫收缩等原因导致。
妇科相关原因
月经相关： 除了前面提到的生理期轻微隐痛，有些女性在月经期间，子宫内膜前列腺素含量增高，可能会引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现下腹疼痛，疼痛程度因人而异。妊娠相关： 对于有性生活的女性，若出现小腹正中最下面隐隐作痛，还要考虑异位妊娠可能，比如输卵管妊娠，在胚胎生长过程中可能会导致输卵管膨胀等引起隐痛，若异位妊娠发生破裂，就会出现剧烈腹痛等严重情况。
肠道相关原因
便秘： 当大便干结，在肠道内积聚，可能会引起小腹正中最下面隐隐作痛，一般还会伴有排便困难等表现。长时间便秘的人，这种情况相对常见。肠炎： 饮食不洁等可能导致肠炎，肠道发生炎症反应时，也可能出现小腹正中下方隐痛，同时可能伴有腹泻、腹胀等症状，比如细菌性肠炎，就可能因为细菌感染肠道引发炎症导致疼痛。
泌尿系统相关原因
膀胱炎： 女性尿道短而直，容易发生膀胱炎，膀胱黏膜受到炎症刺激，可出现小腹正中最下面隐隐作痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状，尤其是急性膀胱炎发作时，这些症状可能比较明显。输尿管结石： 输尿管结石下移过程中，可能会引起小腹正中下方的隐痛，同时可能伴有腰痛、血尿等表现，结石活动刺激输尿管时疼痛可能会较为明显。