宝宝发烧39度且处于熟睡状态时，可通过饮食、冷敷、药物等方式来治疗。具体如下：
一、饮食：宝宝发烧39度在熟睡中时要将其叫醒，然后给孩子少量多次喂温开水。这样能促进排泄，让热量被带走，从而降低体温。而孩子清醒后其体温调节能力会增强，对降温有帮助作用。
二、冷敷：当宝宝发烧39度处于熟睡中，还可采取冷敷这一方式。可在宝宝的手腕、额头、小腿处放上湿冷毛巾进行降温，待冷敷的毛巾温度升高后再进行更换，如此重复可起到很好的辅助治疗效果。
三、药物：要是宝宝发烧39度用上述方法没有取得良好的治疗效果，那么宝宝可在医生指导下使用利巴韦林、阿昔洛韦、更昔洛韦等抗病毒药物进行治疗，同时还可遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚等解热镇痛药物进行治疗。
总结：宝宝发烧39度熟睡时，可根据具体情况选择饮食、冷敷、药物等方式进行治疗，以帮助宝宝降低体温，缓解不适。但使用药物需在医生指导下进行，确保治疗的安全和有效性。